PCR (Polymerase Chain Reaction) |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (PCR (Polymerase Chain Reaction) |
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Ces techniques ont permis d’isoler des gènes appartenant aux éléments génétiques mobiles chez des bactéries provenant de sédiments côtiers pollués par du pétrole. |
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Clonage |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Clonage |
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Le clonage permet de cribler les éléments génétiques mobiles obtenus (cassettes de gènes d’intégrons) afin de les séparer, et de pouvoir cribler la banque afin d’en dégager les gènes qui ont été mo… |
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Analyse de séquences |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Analyse de séquences |
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L’analyse des séquences a permis d’estimer la diversité d’intégrons (éléments génétiques mobiles) présente dans les échantillons, et de suivre cette diversité au cours de la pollution pendant 9 moi… |
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Dot-blot |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Dot-blot |
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Les techniques d’hybridation ont permis d’observer l’activité du gène responsable de la mobilité des cassettes de gènes. Cette activité étant trop faible pour être visible par RT-PCR dans un métatr… |
chambre noire, salle spécifique manipulation de produits radioactifs, scanner à fluorescence |
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Northen-blot |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Northen-blot |
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Les techniques d’hybridation ont permis d’observer l’activité du gène responsable de la mobilité des cassettes de gènes. Cette activité étant trop faible pour être visible par RT-PCR dans un métatr… |
chambre noire, salle spécifique manipulation de produits radioactifs, scanner à fluorescence |
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Southern-blot |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Southern-blot |
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Les techniques d’hybridation ont permis d’observer l’activité du gène responsable de la mobilité des cassettes de gènes. Cette activité étant trop faible pour être visible par RT-PCR dans un métatr… |
chambre noire, salle spécifique manipulation de produits radioactifs, scanner à fluorescence |
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Hybridation sur colonie |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Hybridation sur colonie |
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L’hybridation sur colonie permettait de savoir quel colonie de clone portait la séquence d’intérêt après PCR sur un métagénome (la diversité des gènes amplifiés peut-être très grande en fonction de… |
Technologie(s) utilisée(s) non-renseignée(s) | |
Reverse Transcription PCR (RT-PCR) |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Reverse Transcription PCR (RT-PCR) |
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La RT-PCR a permis de voir en présence ou non de pétrole dans une population microbienne dans quelle condition certains gènes s’exprimaient. |
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Real-Time qPCR |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Real-Time qPCR |
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Après étude de la diversité des intégrons à différents stade d’une pollution pétrolière, une étude par PCR quantitative a permis de quantifier ces éléments génétiques au sein de la communauté micro… |
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Culture bactéries en condition aérobie |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Culture bactéries en condition aérobie |
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Afin de développer la technique qui permettant d’isoler les gènes ayant été mobilisé en dernier dans les intégrons d’un métagénome, il a d’abord fallu travaillé sur une souche bactérienne possédant… |
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PCR métagénome |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (PCR métagénome |
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Thermocycleur, enzymes |
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Extraction d'acides nucléiques - ADN |
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| Mise en place de cette expertise par Lionel Huang | Technologie(s) utilisée(s) |
Découvrez comment Lionel Huang a mis en place cette expertise (Extraction d'acides nucléiques - ADN |
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Extraction de l’ADN total d’échantillons de sédiments côtiers soumis à une pollution pétrolière. |
Kit optimisés pour le métagénome |
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